Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIM23P36406 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms