Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD12P35452 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms