Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms