Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB9P28065 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms