Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms