Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5F1P24539 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5F1P24539 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms