Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ME2P23368 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ME2P23368 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ME2P23368 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ME2P23368 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms