Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDSP20132 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SDSP20132 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDSP20132 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDSP20132 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDSP20132 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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