Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD58P19256 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD58P19256 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD58P19256 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD58P19256 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms