Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF3P18847 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF3P18847 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF3P18847 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms