Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA6P17658 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms