Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB4P17483 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB4P17483 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB4P17483 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB4P17483 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB4P17483 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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HOXB4P17483 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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