Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA1P17302 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms