Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms