Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPCP11686 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFTPCP11686 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFTPCP11686 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms