Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF3P11487 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF3P11487 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF3P11487 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF3P11487 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF3P11487 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGF3P11487 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGF3P11487 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGF3P11487 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms