Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOP2AP11388 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP2AP11388 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms