Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNB1P11230 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNB1P11230 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms