Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms