Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATE1O95260 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATE1O95260 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATE1O95260 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATE1O95260 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATE1O95260 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms