Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRATO95237 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRATO95237 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRATO95237 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRATO95237 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms