Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F6O75461 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms