Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms