Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SURF4O15260 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SURF4O15260 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SURF4O15260 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SURF4O15260 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms