Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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