Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HACD1B0YJ81 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms