Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms