Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
YBX2Q9Y2T7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms