Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TTF2Q9UNY4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TTF2Q9UNY4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms