Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TMCC3Q9ULS5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMCC3Q9ULS5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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