Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms