Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL13Q9P2N7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms