Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms