Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK13-1Q9NX77 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms