Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RLIMQ9NVW2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms