Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms