Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDM8Q9NQV8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms