Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms