Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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