Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF17Q9BXT8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms