Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL3Q9BXA9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms