Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LRRC61Q9BV99 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LRRC61Q9BV99 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LRRC61Q9BV99 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LRRC61Q9BV99 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LRRC61Q9BV99 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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LRRC61Q9BV99 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC61Q9BV99 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms