Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAT1Q99536 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAT1Q99536 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms