Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNBD2Q96M20 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms