Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BORCS6Q96GS4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms