Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms