Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms