Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBP4Q8N2S1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms