Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms