Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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